Diğer yeni H1 antihistaminiklerde olduğu gibi , setirizinde de bitkinlik , başağrısı , huzursuzluk , ajitasyon , ağız kuruluğu , gastrointestinal rahatsızlık gibi geçici yan etkiler rapor edilmiştir. Çok seyrek olarak ; Asteni , sırt ağrısı , göğüs ağrısı , yüz ödemi , ateş , genel ödem , sıcak basması , kilo kaybı , bacaklarda ödem , kırıklık , nazal polip , ağrı , solgunluk , periorbital ödem , periferal ödem görülebilir. Ayrıca çok nadiren fakat şiddetli yan etkiler de tespit edilmiştir. Bunlar:Anafilaksi , kolestaz , glomerulonefrit , hemolitik anemi , hepatit (Setirizin tedavisi esnasında bazen , geçici hepatik transaminaz seviyesinde yükselme olabilir.Setirizin kullanımında , önemli transaminaz ve bilirubin yükselmesi ile birlikte hepatit kaydedilmiştir. ), orofasiyal diskinezi , şiddetli hipotansiyon , stillbirth , trombositopeni’ dir.